A mi en otro coche más sencillo (un Ford TDdi 90cv) con un fallo parecido, era el sensor de impulsos del cigüeñal. Este sensor lo tiene el TDCi que es "descendiente" del mío y cuya tecnología se ha aplicado a los HDi.
Si es eso, la pieza te valdrá unos 40.
También deberías revisar el cableado de la bomba inyectora, ya que si por la vibración, baches, etc... no hace buen contacto, te empezará a dar fallos tontos.
Ya nos cuentas que tal.
P.D. Si es taller oficial, lo que te han dicho, y si es taller no oficial, ponle una denuncia en consumo. Los fallos "fantasma" siempre hay que ir de lo más barato a lo más caro... y el mecánico se ha ido a sacar pasta.