Buenas:
La radio Alpine de 4x45 tendrá unos 25-30w RMS. El altavoz aguanta 45w RMS, así que estás dentro de rango. No le hace falta etapa. Como bien dice Platikis, si pones un sub sí que deberías ponerle etapa a este. RMS es la potencia media eléctrica que da un amplificador y la máxima se refiere al pico más alto de potencia que puede dar (45w en tu radio, mas o menos) En los altavoces, las potencias se refieren a la máxima potencia que pueden soportar sin dañarse. El RMS, tambien conocido como nominal, es la media máxima que aguantan y el pico es el pico máximo que pueden soportar. Algunos especifican cual es la potencia RMS mínima recomendable. La idea es que la potencia de la estapa esté entre la mínima y la máxima RMS qur acepte el altavoz.
Hay gente que opina que cuanto más potentes son los altavoces más sonará el equipo. Eso es totalmente falso. De hecho, puede que suene peor, ya que si ponemos un altavoz con una RMS muy alta, se necesita una etapa con mucha potencia para moverlo, y si la radio no lo puede hacer, sonará patata. En tu caso, parece estar bien medido.
Para lo del subwoofer, dependerá del tamaño de los altavoces que hayas montado en la bandeja. Si son 16cm (6 pulgadas, más o menos) con un 10" tendrás suficiente con una etapa que de unos 100-120 rms en mono. Si has montado altavos ovalados de 6x9 pulgadas, lo m´s recomendable sería poner un12" con unos 150-180 RMS. En tu caso, yo sacrificaría un poco el ampli del sub, con 80-100 RMS y no le metas filtro. Si le metes mucha caña y con un filtro pasabajos, lo único que conseguiras es que suene mucho bajo, que te tapará el resto del sonido. Debes buscar que esté equilibrado, ys que los altavoces van con la radio, que no tiene mucha potencia.