Primero probaria a cambiar el filtro del habitaculo, aqui en la seccion de bricos tienes uno muy bien explicado:
http://citroen.mforos.com/1257918/7[....]o-polen-c5ii-paso-a-paso-con-fotos/
En cualquier tienda de recambios cuesta unos 20€.
Si te sigue oliendo mál limpiaria los conductos por si te hubiera entrado algun residuo y luego probaria a buscar el desague que comentas, pero me parece que el sistema de desague del aire esta fuera ya que el agua del compresor la gotea por la parte delantera derecha del morro por lo que me extrañaria que ese desague te de problemas, al estar desvinculado del flujo de aire, otra cosa es que haya uno para el habitaculo por la condensación, pero me parece que no existe aunque nos lo confirmaran seguro.